食品農(nóng)產(chǎn)品認證的作用和意義歸納起來主要是以下幾個方面：

（一）充分利用社會資源，實現(xiàn)認證全過程監(jiān)管，切實保障食品安全。我國食品安全監(jiān)管采用由不同政府部門分段管理的模式,而認證可以貫穿種植、養(yǎng)殖、加工、儲存、運輸、銷售等各個環(huán)節(jié)，且要求認證機構(gòu)必須實施有效的認證后跟蹤監(jiān)督，可以彌補食品安全行政監(jiān)管資源的不足和可能存在的漏洞，有力保障食品安全。

（二）改善農(nóng)村環(huán)境，促進生態(tài)文明建設(shè)，實現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。食品農(nóng)產(chǎn)品認證制度提倡或強制要求不使用或少使用化肥、農(nóng)藥、食品添加劑等投入物質(zhì)，有利于減少面源污染，保護農(nóng)村環(huán)境，轉(zhuǎn)變生產(chǎn)方式，實現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。

（三）調(diào)整農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)，提高農(nóng)民收入，促進農(nóng)產(chǎn)品出口。經(jīng)認證的產(chǎn)品在市場上銷售時可以獲得更多附加值，良好農(nóng)業(yè)規(guī)范認證、有機產(chǎn)品認證、危害分析與關(guān)鍵控制點體系認證等與國際接軌的認證形式還可順利突破國際貿(mào)易技術(shù)壁壘，使產(chǎn)品更順利地進入國際市場。