有機(jī)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)強(qiáng)調(diào)優(yōu)先使用當(dāng)?shù)刭Y源，優(yōu)化在同一土地上多種植物和動物對資源的利用。這種時間和空間上生物多樣性的管理，是農(nóng)民對農(nóng)業(yè)系統(tǒng)的生產(chǎn)性“投入”。 

　　農(nóng)民在多種層次上同時是生物多樣性的管理者和用戶。基因?qū)哟危菏走x使用本地的種子和品種，本地品種有較高的抗病性，對當(dāng)?shù)貧夂蛴休^高的適應(yīng)性。物種層次：動植物多樣化的組合，優(yōu)化農(nóng)業(yè)生產(chǎn)體系內(nèi)部養(yǎng)分和能量的循環(huán)。生態(tài)層次：維護(hù)農(nóng)田及其周圍區(qū)域的自然性質(zhì)，不使用化學(xué)投入物，營造適合野生動植物的生活環(huán)境。依靠自然控制的方法，保持生物多樣性，避免害蟲由于化學(xué)防治所產(chǎn)生的選擇抗藥性。 

　　有機(jī)農(nóng)業(yè)與土壤生態(tài)系統(tǒng)有機(jī)農(nóng)業(yè)強(qiáng)調(diào)依靠土壤的自然肥力牞采用作物輪作、生物共生、種植綠肥作物、使用有機(jī)肥和減少耕作等措施。長期采用有機(jī)農(nóng)業(yè)方法，可以顯著增加土壤中生命體的數(shù)量和種類，如有益節(jié)肢動物、蚯蚓、共生生物和細(xì)菌等，特別是一些瀕臨滅絕的土壤物種。有“生命力”的土壤有如下作用：無脊椎動物（如蚯蚓等）分解植物殘體，有利于養(yǎng)分、氧氣和水分循環(huán)。微生物（如細(xì)菌和真菌）將作物不可利用的營養(yǎng)元素分解為有效養(yǎng)分，促進(jìn)養(yǎng)分循環(huán)，降解有毒物質(zhì)。在有機(jī)農(nóng)業(yè)系統(tǒng)中，較高的生物量和微生物種群密度，提高了土壤碳元素的保持力。 

　　有機(jī)農(nóng)業(yè)與農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)在有機(jī)農(nóng)業(yè)系統(tǒng)中，必須加強(qiáng)作物自身的抗病性和害蟲天敵的作用。作物輪作是土壤管理的基礎(chǔ)，是害蟲治理和土壤肥力管理的工具。輪作、間作、建立“作物－樹木－動物” 綜合生產(chǎn)體系這些技術(shù)措施，為有益生物提供了棲息地，吸引害蟲天敵和授粉昆蟲到系統(tǒng)中棲息、繁衍。通過促進(jìn)當(dāng)?shù)刂参锖蛣游锏南嗷プ饔脕肀Ｗo(hù)農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)。生物多樣性的有機(jī)農(nóng)場對改善農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)有如下作用，氮循環(huán)：在輪作中種植豆科植物和其他固氮植物（如苜蓿）固定空氣中的氮。共生和寄生：共生生物（如菌根）在吸收養(yǎng)分和減少病原菌侵害方面扮演最重要的角色；寄生可用于對蟲害的生物控制。捕食：捕食性天敵和被捕食昆蟲間的內(nèi)部競爭可以將害蟲控制于一定水平之下。傳粉：由于在有機(jī)農(nóng)場改善了棲息地的環(huán)境，不使用化學(xué)農(nóng)藥，傳粉昆蟲數(shù)量下降的勢頭得到控制。很多農(nóng)作物和開花植物必須由昆蟲（蜜蜂、蝴蝶、甲殼蟲）和其他動物傳粉。 

　　有機(jī)農(nóng)業(yè)與自然保護(hù)在有機(jī)農(nóng)業(yè)系統(tǒng)中，保護(hù)與農(nóng)田相鄰周圍的自然植被是通常的做法，給多種昆蟲的天敵、野生動物、鳥類和其他野生生物提供可替代的食物和棲息地。有機(jī)農(nóng)業(yè)生態(tài)環(huán)境對保護(hù)野生生物起到如下作用：按有機(jī)農(nóng)業(yè)方式生產(chǎn)，農(nóng)田的生物多樣性和植物生物產(chǎn)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于常規(guī)種植；由于大量的食物來源和棲息地，豐富了有機(jī)農(nóng)田的生物區(qū)系，例如有機(jī)農(nóng)業(yè)對阻止地面孵化的鳥類種類的下降起著積極作用；在農(nóng)田占支配地位的地區(qū)，按有機(jī)農(nóng)業(yè)要求設(shè)置緩沖帶，對保護(hù)野生動物十分重要。　　 

　　有機(jī)農(nóng)業(yè)可以提高農(nóng)田生產(chǎn)能力如果不按有機(jī)農(nóng)業(yè)方式生產(chǎn)，會導(dǎo)致農(nóng)田喪失生物多樣性，造成周圍生態(tài)環(huán)境退化。因此，取代以往以增加資本投入和大量使用化學(xué)投入物增加產(chǎn)量的做法，而用改善生物多樣性、促進(jìn)養(yǎng)分循環(huán)，以及協(xié)調(diào)作物、動物、土壤和其他生物組成的相互作用，促進(jìn)資源保護(hù)和再生的有機(jī)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)方式，是提高農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、解決產(chǎn)量問題的一條可以實(shí)踐的途徑。 

　　從常規(guī)種植向有機(jī)種植轉(zhuǎn)換是增產(chǎn)還是減產(chǎn)？在許多情況下，在開始轉(zhuǎn)換之初會出現(xiàn)減產(chǎn)，特別是那些原來嚴(yán)重依賴化肥和農(nóng)藥投入的地區(qū)。但是，在那些原來對農(nóng)藥、化肥依賴較少的地方，轉(zhuǎn)換到有機(jī)種植就可能不會減產(chǎn)，相反還可能增產(chǎn)。這種有機(jī)種植生產(chǎn)能力的增加來自以下一個或幾個原因：通過輪作、間作和多樣種植，農(nóng)業(yè)生產(chǎn)系統(tǒng)生物多樣性得到改善；種植或間作綠肥作物；通過利用作物秸稈還田（或制作堆肥以后還田），促進(jìn)了農(nóng)田養(yǎng)分循環(huán)；較好地利用周圍生態(tài)系統(tǒng)有機(jī)物質(zhì)；較好地利用自然資源，尤其是水資源（例如覆蓋、增加土壤有機(jī)質(zhì)含量）；將養(yǎng)殖業(yè)和種植業(yè)結(jié)合起來，改善養(yǎng)分管理水平；更加注意水土保持。必須指出的是，單單靠有機(jī)農(nóng)業(yè)不能解決所有生產(chǎn)問題。例如，在多數(shù)情況下，有機(jī)農(nóng)業(yè)為恢復(fù)由于常規(guī)農(nóng)業(yè)而退化的農(nóng)田提供了可以實(shí)踐的方法，但是，在那些土壤和周圍環(huán)境退化過于嚴(yán)重的地區(qū)，單單采用有機(jī)農(nóng)業(yè)的措施不能保證恢復(fù)和增加生產(chǎn)能力。在這些情況下，有必要將有機(jī)農(nóng)業(yè)和修復(fù)生物多樣性為目標(biāo)的農(nóng)業(yè)系統(tǒng)重新結(jié)合起來。　　 

　　有機(jī)農(nóng)業(yè)至少可以從以下4個方面來增加農(nóng)民收入，提高效益：不支出或減少支出購買化肥、農(nóng)藥的成本；生產(chǎn)多樣化和優(yōu)化；保持和促進(jìn)農(nóng)田和周圍的生物多樣性；在市場上賣得較高的價格。與常規(guī)農(nóng)業(yè)相比，有機(jī)農(nóng)業(yè)顯然是一種可持續(xù)的生產(chǎn)方式，將其付諸實(shí)踐，可實(shí)現(xiàn)社會、經(jīng)濟(jì)和環(huán)境的可持續(xù)發(fā)展。