大規(guī)模、集約化畜牧場的出現(xiàn)，大量的畜禽糞、尿和污水導(dǎo)致環(huán)境污染，國外曾有“畜產(chǎn)公害”之稱。目前，我國的“畜產(chǎn)公害”十分嚴(yán)重。對畜禽糞尿污染的治理方法很多，如沼氣發(fā)酵，還有快速烘干等，還可利用某些微生物對廢棄物的分解，將自然界的生物循環(huán)引導(dǎo)到更利于維護(hù)生態(tài)環(huán)境的方向。近年來各國微生物專家研制出一批用于處理畜禽糞便和治理污水的微生物生態(tài)環(huán)境保護(hù)劑，如用于養(yǎng)豬業(yè)的環(huán)境清潔劑——木糠床微生態(tài)菌劑，在許多國家和地區(qū)都已廣泛應(yīng)用。中國臺北在推廣木糠床養(yǎng)清法過程中，研制出適合于高溫、潮濕氣候的亞羅康免洗豬舍養(yǎng)豬法，亞羅康微生物制劑除具有活菌飼料添加劑的功能外、還有消除畜禽糞便惡臭、凈化飼養(yǎng)環(huán)境的獨特功效。微生物生態(tài)環(huán)保制劑還包括快速堆肥制劑和污水處理微生態(tài)菌劑等。