與DNA斑點(diǎn)雜交類似，每個樣品至多加10μg總RNA（經(jīng)酚/氯仿或異硫氰酸胍提取純化）。方法是將RNA溶于5μlDEPC水，加15μl甲醛/SSC緩沖液（10×SSC中含0.15mol/l 甲醛）使RNA變性。然后取5～8μl點(diǎn)樣于處理好的濾膜上，烘干。
　　培養(yǎng)細(xì)胞，標(biāo)本處理技術(shù)可以簡化，不用提取和純化RNA。方法是用含0.5%Nonidet P40的低滲緩沖液對多種動物細(xì)胞作簡單處理，離心去掉細(xì)胞核和細(xì)胞碎片，就得到基本不帶DNA而富含RNA的細(xì)胞質(zhì)提取物，這一粗RNA在高鹽下用甲醛變性，不需加工直接點(diǎn)到硝酸纖維素膜上。本法可以快速檢測大量標(biāo)本，而只需極少量的細(xì)胞（5×104）或組織。
　　整個RNA實驗中，要防止激活內(nèi)源性RNase，有許多種預(yù)防措施，有一種是在樣品中加入核糖核苷氧礬基復(fù)合物（RVC）。