組成蛋白質(zhì)基本結(jié)構(gòu)的多肽鏈兩端,原則上是一端有一個氨基末端殘基,另一端帶有一個羧基末端殘基。前者是將α氨基保持游離狀態(tài)的氨基酸殘基,后者是將α羧基保持游離狀態(tài)的氨基酸殘基。采用1-氟-2,4-二硝基苯的桑格(F.Sanger)的DNP法(DNP method),在歷史上是很著名的。該法可作為鑒定或定量分析位于氨基末端的氨基酸殘基的方法。也廣泛采用將DNP法超微量化的dansyl法(用5-二甲氨基萘磺酰氯)。Edman降解法是從氨基末端開始測定氨基酸排列順序的有效分析法。還可采用氨肽酶降解進(jìn)行氨基末端分析。