繁殖用原種小鼠必須遺傳背景明確,來源清楚、有完整的譜系資料,包括品系名稱、近交代數(shù)、遺傳基因特點及主要生物學(xué)特征等。引種小鼠應(yīng)來自近交系的基礎(chǔ)群， 以2～5對同窩個體為宜。
小鼠近交系一旦育成，應(yīng)按保種的有關(guān)規(guī)定，維持其特定的生物學(xué)特征的穩(wěn)定，保持其基因性同一和基因純合性。近交系小鼠的維持和生產(chǎn)包括4個群。生產(chǎn)過程一般是從基礎(chǔ)群移出種子，經(jīng)擴大群擴增后，建立生產(chǎn)群，由生產(chǎn)群繁殖仔鼠進入供應(yīng)群。
（1）基礎(chǔ)群：嚴格采用全同胞兄妹交配，用基礎(chǔ)平行線系統(tǒng)保持品系的種源，為擴大群提供種鼠。在繁殖過程中一般保持2～4個平行譜系分支,在4～7代時進行一次修飾。每個譜系分支上，保留7～12個繁殖對，留種的同胞兄妹保持相應(yīng)的數(shù)量及與原品系相同的特性。應(yīng)保證小鼠不超過5～7代能追溯到一對共同祖先。
（2）血緣擴大群：種鼠來源于基礎(chǔ)群，采用全同胞兄妹交配繁殖。用來擴大群體個體數(shù)量，為生產(chǎn)群提供種鼠。血緣擴大群應(yīng)設(shè)個體繁殖記錄卡，本群小鼠不應(yīng)超過5～7代而能追溯到其在基礎(chǔ)群的一對共同祖先。
（3）生產(chǎn)群：隨機交配，用于生產(chǎn)供實驗用的小鼠，經(jīng)4 個世代繁殖后即可淘汰。生產(chǎn)群種小鼠來自基礎(chǔ)群或血緣擴大群。為了便于控制隨機交配不超過4個世代,可采用掛指示牌的方法：從擴大群來的種鼠F0代掛白牌，F(xiàn)1代掛藍牌，F(xiàn)2代掛黃牌，F(xiàn)3代掛紅牌。紅牌表示已繁殖到第三世代，需更換種鼠，從擴大群取來種鼠，繼續(xù)生產(chǎn)。
（4）供應(yīng)群：來源于上述生產(chǎn)群中每個世代繁殖的仔鼠，育成后供實驗用。
為保證上述4個種群連續(xù)性，應(yīng)做好配種計劃。
注意在生產(chǎn)中從基礎(chǔ)群到生產(chǎn)群必須控制在15代以內(nèi)，即生產(chǎn)群的小鼠上溯15代可在基礎(chǔ)群找到共同祖先。各群之間不能有小鼠逆向流動。當(dāng)小鼠出現(xiàn)斷代時，可從血緣擴大群中選譜系記錄清楚的小鼠重新建立基礎(chǔ)群。
同時應(yīng)注意某一品系小鼠混入其它小鼠時應(yīng)立即淘汰,逃出鼠盒的小鼠應(yīng)立即淘汰。經(jīng)過某些技術(shù)處理如人工代乳、卵巢移植等的小鼠可能形成亞系或亞群，而 
應(yīng)與原種群混雜。