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      Western blot常見(jiàn)問(wèn)題及注意事項(xiàng)(一)

      放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2024-11-14  來(lái)源:上海撫實(shí)實(shí)業(yè)
      核心提示:1、我的細(xì)胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?答:有沉淀可能因?yàn)槟愕牡鞍讻](méi)有變性全,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時(shí)

      1、我的細(xì)胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?
      答:有沉淀可能因?yàn)槟愕牡鞍讻](méi)有變性全,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時(shí)將樣品煮沸時(shí)間延長(zhǎng); 也不排除你的抗原濃度過(guò)高,這時(shí)再加入適量上樣緩沖液即可。

      2、我做的蛋白質(zhì)分子量很。10
      kd),請(qǐng)問(wèn)怎么做WB?
      答:可以選擇0.2μm的膜,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。

      3、最后顯色時(shí)用 DAB好還是ECM好?
      答:DAB有毒,但是比較靈敏,是HRP最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制,但被催化時(shí)靈敏度差一點(diǎn),但如果達(dá)到閥值,就特別靈敏,可以檢測(cè)pg 級(jí)蛋白,具體可以根據(jù)你實(shí)驗(yàn)的情況。

      4、要驗(yàn)證某個(gè)細(xì)胞上有無(wú)該蛋白的存在,需要做免疫組化和
      Western Blot試驗(yàn)嗎?做這兩個(gè)試驗(yàn)時(shí)的一抗和二抗可以共用嗎?
      答:
      ①免疫組化可以用來(lái)進(jìn)行定位,但是不能精確定量,而且有時(shí)會(huì)有假陽(yáng)性,不易與背景區(qū)分;Western blot可以特異性檢測(cè)某個(gè)蛋白質(zhì)分子,進(jìn)行定 量,但是不能定位。
      ②兩種實(shí)驗(yàn)的一抗有時(shí)候不能通用,公司的產(chǎn)品說(shuō)明一般都會(huì)說(shuō)明可以進(jìn)行什么實(shí)驗(yàn),在免疫組化時(shí),是否適合石蠟切片或者冰凍切片。

      5、細(xì)胞水平要做
      Western Blot,多少細(xì)胞提的蛋白夠做Western Blot?
      答:一般5×106就足夠了。

      6、同一樣品能同時(shí)提RNA又提蛋白么?這樣對(duì)
      Western Blot有無(wú)影響?
      答:能,沒(méi)有問(wèn)題。

      7、同一蛋白樣品能同時(shí)進(jìn)行兩種因子的Western Blot檢測(cè)嗎?
      答:當(dāng)然可以,有的甚至可以同時(shí)測(cè)幾十種樣品。

      8、蛋白變性后可以存放多久?
      答:-80℃,一兩年沒(méi)有問(wèn)題。最關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細(xì)菌消化掉(也是被酶水解了)。

      9、二抗是生物素化的抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?
      答:不能使用脫脂奶粉,因?yàn)槊撝谭壑泻锼兀肂SA代替應(yīng)該好一點(diǎn)。

      10、做組織樣品的
      Western Blot的時(shí)候,怎樣處理樣品?
      答:必須進(jìn)行研磨、勻漿、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會(huì)更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點(diǎn)就是組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),需要注意抑制蛋白酶的活性。

      11、免疫組化和Western Blot可以用同一種抗體嗎?
      答:免疫組化時(shí)抗體識(shí)別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構(gòu)象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構(gòu)象型表位由于受蛋白空間結(jié)構(gòu)限制,煮后變性會(huì)消失。如果你所用的抗體識(shí)別的是蛋白上連續(xù)的幾個(gè)氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時(shí)用于免疫組化和Western,而如果抗體識(shí)別構(gòu)象形表位,則只能用于免疫組化。

      12、在做Western Blot時(shí),PVDF膜用甲醇浸泡的目的?
      答:PVDF膜用甲醇泡的目的是為了活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更容易跟帶負(fù)電的蛋白質(zhì)結(jié)合,做小分子的蛋白轉(zhuǎn)移時(shí)多加甲醇也是這個(gè)目的。

      13、檢測(cè)同一抗體的磷酸化和非磷酸化的抗原可以在同一張膜上嗎?
      答:可以。

      14、蛋白質(zhì)的分子量跨度很大,如要分離小21
      kd,中至66kd,大至170kd,可以一次做好嗎?
      答:這么廣的分布不好轉(zhuǎn)移,一般建議:21kd和66kd可以一起轉(zhuǎn),12%SDS-PAGE,濕轉(zhuǎn)120mA, 45-60min就可以了, 可以根據(jù)你實(shí)驗(yàn)室的經(jīng)驗(yàn)調(diào)節(jié);170kd 用 7% SDS-PAGE,200mA 90-120min。

      15、細(xì)胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時(shí)有什么原則嗎?受不受組織來(lái)源的影響?胞膜和胞漿有區(qū)別嗎?
      答:一般來(lái)說(shuō)提取時(shí)加入廣譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時(shí)保持低溫。若有特殊要求可以選擇相應(yīng)的蛋白酶抑制劑。

      編輯:songjiajie2010

       
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