根據(jù)《外國(guó)公司船舶運(yùn)輸收人征稅辦法》(財(cái)稅字[1996]087)(以下簡(jiǎn)稱(chēng)《征稅辦法》)的規(guī)定，外國(guó)公司以船舶從中國(guó)港團(tuán)運(yùn)藏旅客、貨物或者郵件出境的，所取得的運(yùn)輸收人、所得應(yīng)在中由進(jìn)行納稅。取得運(yùn)輸收入的承運(yùn)人為納稅人．包話實(shí)方派船的期租船，以外國(guó)公司為納稅人；承租船，以外國(guó)由東為納稅人；中國(guó)租用外國(guó)籍船舶再以期租方式轉(zhuǎn)租給外國(guó)公司的，以外國(guó)司為納稅人；外國(guó)公司期租的中國(guó)籍船舶，以外國(guó)公司為納稅人，其他外國(guó)籍船舷，以其船公司為納稅人。繳納的營(yíng)業(yè)稅為收人總額的3％，企業(yè)所得稅為收入總額的1.65%。

　　為了進(jìn)一步加強(qiáng)和完善外國(guó)司船舶運(yùn)輸收入的稅收管理以及國(guó)際海運(yùn)業(yè)對(duì)外支付管理，國(guó)家稅務(wù)總局、自家外匯管理局2001年12月4日發(fā)布了《關(guān)于加強(qiáng)外國(guó)公司船舶運(yùn)輸收入稅收管理及國(guó)際海運(yùn)業(yè)對(duì)外支付管理的通知》(國(guó)稅發(fā)[2001]139號(hào))(以下簡(jiǎn)稱(chēng)《通知》。該通知自2002年5點(diǎn)1日起執(zhí)行。

　　(通知)規(guī)定，負(fù)責(zé)向取得船舶運(yùn)輸收入的外國(guó)公司直接或間接支付運(yùn)費(fèi)的單位或個(gè)人為外國(guó)公司應(yīng)納稅款的扣繳義務(wù)人，包括外商獨(dú)資船務(wù)公司、國(guó)家船舶代理公司、國(guó)際貨運(yùn)代理公司、以及其他對(duì)外支付國(guó)際海運(yùn)運(yùn)費(fèi)的單位或個(gè)人�？劾U義務(wù)人在每次對(duì)外支付運(yùn)費(fèi)前，以對(duì)外支付運(yùn)費(fèi)總額為應(yīng)納稅入總額，按照規(guī)定的稅串直接從納稅人的運(yùn)費(fèi)總額中代扣應(yīng)納稅款。同時(shí)，扣繳義務(wù)人應(yīng)分別向當(dāng)?shù)刂鞴車(chē)?guó)家稅務(wù)局報(bào)送(代扣代繳外國(guó)公司船舶運(yùn)輸收入所得稅報(bào)告表)，向地方稅務(wù)局報(bào)送(代扣代繳外國(guó)公司船舶運(yùn)輸收入營(yíng)業(yè)稅報(bào)告表)。

　　按照我國(guó)同其他田家締結(jié)的避免雙重征稅協(xié)定、互免海運(yùn)企業(yè)國(guó)際運(yùn)輸收入?yún)f(xié)定、海運(yùn)協(xié)議以及英他有關(guān)協(xié)議或換文，外國(guó)公司可以享受減稅或免稅待遇的，須自行或委托其扣繳義務(wù)人分別向當(dāng)?shù)刂鞴車(chē)?guó)家稅務(wù)局填報(bào)(外國(guó)公司船船運(yùn)輸收入免征企業(yè)所得稅證明表)，向當(dāng)?shù)刂鞴艿胤蕉悇?wù)局填報(bào)(外國(guó)公司船舶運(yùn)輸收人免征營(yíng)業(yè)稅證朗表)，并提供其他有關(guān)證明文件。末申增免稅或不能提供有關(guān)證明文件的，不得享受免稅待遇。外國(guó)公司不能及時(shí)提交免稅證明的，應(yīng)先按規(guī)定交稅，待取得免稅證明后再辦理退稅。

　　扣繳義務(wù)人在國(guó)際貿(mào)易出口項(xiàng)下向外國(guó)公司支付運(yùn)費(fèi)時(shí)，應(yīng)向外匯指定銀行提交完稅憑證或免稅證明。不能按要求提供完稅憑證或免稅證明的，不得對(duì)外付匯。根據(jù)《稅牧征收管理法》的規(guī)定，扣繳義務(wù)人應(yīng)扣末扣、應(yīng)收而不收稅款的，由稅務(wù)機(jī)關(guān)向納稅人追繳稅款，對(duì)扣繳義務(wù)人處應(yīng)扣末扣、應(yīng)收來(lái)收稅款50%以上三倍以下的罰款。

　　無(wú)船承運(yùn)人稅收管理

　　根據(jù)《國(guó)際梅運(yùn)條例》及有關(guān)規(guī)定，中國(guó)企業(yè)法人和境外國(guó)際船船運(yùn)輸公司在中國(guó)境內(nèi)從事無(wú)船承遠(yuǎn)業(yè)務(wù)，應(yīng)向交通部提出申請(qǐng)并提交有關(guān)申謂材料，取得《無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)經(jīng)營(yíng)資格登記證》。《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于從事國(guó)際海運(yùn)無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)使用發(fā)票有關(guān)問(wèn)題的通知》(國(guó)稅函[2002]404號(hào))規(guī)定，在中國(guó)境內(nèi)注冊(cè)，并依法取得交通部(無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)經(jīng)營(yíng)資格登記證)的企業(yè)，可以向稅務(wù)機(jī)關(guān)申謂辦理領(lǐng)購(gòu)、使用《國(guó)際海運(yùn)業(yè)運(yùn)輸專(zhuān)用發(fā)票》事宜、領(lǐng)購(gòu)、使用《國(guó)際海運(yùn)業(yè)運(yùn)輸專(zhuān)用發(fā)票》。

　　對(duì)于從事無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)取得的收入是按營(yíng)業(yè)稅交通運(yùn)輸業(yè)稅目(稅率為3％)交稅還是按營(yíng)業(yè)稅服務(wù)業(yè)錦目(稅率為5%)交稅的問(wèn)題，一時(shí)成為人們爭(zhēng)論的焦點(diǎn)。

　　認(rèn)為應(yīng)按交通運(yùn)輸業(yè)稅目交稅的人認(rèn)為，從事無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)的企業(yè)是以承運(yùn)人身份接受托運(yùn)人的貸載，簽發(fā)自己的提單或運(yùn)輸證，向托運(yùn)人收取運(yùn)費(fèi)，承擔(dān)承運(yùn)人責(zé)任，從事的是運(yùn)輸經(jīng)營(yíng)活動(dòng)。因此，應(yīng)按交通運(yùn)輸業(yè)稅目交稅。

　　認(rèn)為應(yīng)按服務(wù)業(yè)稅目交稅的人認(rèn)為，交通運(yùn)輸業(yè)是指使用運(yùn)輸工具或人力、畜力將貨物或旅客送達(dá)目的地，使其空間位置得到轉(zhuǎn)移的業(yè)務(wù)活動(dòng)。雖然無(wú)船承運(yùn)人在無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)中擔(dān)當(dāng)承運(yùn)人的身份，但并沒(méi)有從事稅法規(guī)定的運(yùn)輸經(jīng)營(yíng)活動(dòng)。無(wú)船承運(yùn)人在其經(jīng)營(yíng)活動(dòng)中只不過(guò)是以自己的名義而不是以承運(yùn)人的名義簽發(fā)提單。其取得的收入雖然稱(chēng)為運(yùn)費(fèi)，但其實(shí)際所得仍然是提供運(yùn)輸經(jīng)營(yíng)的組織活動(dòng)所取得的服務(wù)費(fèi)收入，不管這種牧入是代理性質(zhì)的服務(wù)費(fèi)收入還是其他性質(zhì)的服務(wù)費(fèi)收入。因此，無(wú)船承運(yùn)業(yè)務(wù)仍然要按照服務(wù)業(yè)稅目征稅。

　　隨著貨運(yùn)代理人規(guī)模的不斷增大、實(shí)力的不斷增強(qiáng)，其業(yè)務(wù)范圍也不斷擴(kuò)展。有的貨運(yùn)代理人除從事貸運(yùn)代理業(yè)務(wù)之外，還從事運(yùn)輸、倉(cāng)儲(chǔ)等經(jīng)營(yíng)活動(dòng)。這些經(jīng)營(yíng)活動(dòng)雖然都征收營(yíng)業(yè)稅，但屬于不同的營(yíng)業(yè)稅稅目，稅率不同。根據(jù)稅法規(guī)定，納稅人兼有不同稅目應(yīng)稅行為的，應(yīng)當(dāng)分別核算不同稅目的營(yíng)業(yè)額；未分別核算營(yíng)業(yè)額的，從高適用稅率。因此；貨運(yùn)代理人應(yīng)將各種經(jīng)營(yíng)活動(dòng)取得的收入分別核算，避免因會(huì)計(jì)處理不當(dāng)而造成多交稅款的結(jié)果。

　　另外，如果貨運(yùn)代理人從事財(cái)產(chǎn)租貨、貨物運(yùn)輸或倉(cāng)儲(chǔ)保管或等經(jīng)營(yíng)活動(dòng)，應(yīng)注意繳納印花稅。租賃機(jī)動(dòng)車(chē)輛、機(jī)械設(shè)備、船舶等的，應(yīng)按財(cái)產(chǎn)租賃合同金額的千分之一繳納印花稅。從事貨物運(yùn)輸?shù)模瑧?yīng)按貨物運(yùn)輸合同金額的萬(wàn)分之五繳納印花稅。從事倉(cāng)儲(chǔ)、保管業(yè)務(wù)的，應(yīng)按倉(cāng)儲(chǔ)保管合同的干分之一繳納印花稅。對(duì)于不開(kāi)立合同，只開(kāi)立單據(jù)，或者合同不規(guī)范的，應(yīng)按實(shí)際計(jì)算金額繳納印花稅。