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      核酸序列的一般分析流程

      放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-06-28
      1.1 核酸序列的檢索
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide

      1.2 核酸序列的同源性分析
      1.2.1 基于NCBI/Blast軟件的核酸序列同源性分析
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi
      1.2.2 核酸序列的兩兩比較
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html
      1.2.3 核酸序列的批量聯(lián)網(wǎng)同源性分析(方案)

      1.3 核酸序列的電子延伸
      1.3.1 利用UniGene數(shù)據(jù)庫進行電子延伸(方案)
      1.3.2 利用Tigem的EST Machine進行電子延伸
      EST Extractor: http://gcg.tigem.it/blastextract/estextract.html
      EST Assembly: http://www.tigem/ESTmachine.html
      1.3.3 利用THC數(shù)據(jù)庫對核酸序列進行電子延伸
      http://gcg.tigem.it/UNIBLAST/uniblast.html

      1.4 核酸序列的開放閱讀框架分析
      1.4.1基于NCBI/ORF finder的ORF分析
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

      1.5 基因的電子表達譜分析
      1.5.1 利用UniGene數(shù)據(jù)庫進行電子表達譜分析(方案)
      1.5.2利用Tigem的電子原位雜交服務(wù)器進行電子表達譜分析
      http://gcg.tigem.it/INSITU/insitublast.html

      1.6 核酸序列的電子基因定位分析
      1.6.1 利用STS數(shù)據(jù)庫進行電子基因定位
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/sts/epcr.cgi
      1.6.2 利用UniGene數(shù)據(jù)庫進行電子基因定位(方案)

      1.7 cDNA的基因組序列分析
      1.7.1 通過從NCBI查詢部分基因組數(shù)據(jù)庫進行基因組序列的分析(方案)
      1.7.2 通過從NCBI查詢?nèi)炕蚪M數(shù)據(jù)庫進行基因組序列的分析
      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/page.cgi?F=HsBlast.html&&ORG=Hs
      1.7.3 通過從Sanger Centre查詢基因組數(shù)據(jù)庫進行基因組序列的分析
      http://www.sanger.ac.uk/HGP/blast_server.shtml

      1.8 基因組序列的初步分析
      1.8.1 基因組序列的內(nèi)含子/外顯子分析
      http://www.bioscience.org/urllists/genefind.htm
      1.8.2 基因組序列的啟動子分析
      http://www-hgc.lbl.gov/projects/promoter.html

      1.9核酸序列的注冊
      1.9.1 EST序列的注冊(方案)
      1.9.2 較長或全長cDNA序列的注冊(方案)
      1.10待分析序列所對應(yīng)的已知克隆的獲取
      http://image.llnl.gov
       

       

       
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