蛋白芯片技術(shù)是根據(jù)蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用規(guī)律而設(shè)計(jì)的高通量蛋白檢測技術(shù)平臺。其主要特點(diǎn)是將已知蛋白陣列固定在支撐物表面，用來檢測相配對的未知蛋白，這種新技術(shù)使得研究人員可以在一次實(shí)驗(yàn)中比較生物樣品中成百上千的蛋白質(zhì)的相對豐度，相對于傳統(tǒng)技術(shù)而言，效率大為提高。固定在支撐物上的蛋白質(zhì)可以是抗體、抗原、受體、配體、酶、底物以及蛋白結(jié)合因子等。在實(shí)際應(yīng)用中，抗體芯片研究得最多，其次是酵母雙雜交技術(shù)。后者是將表達(dá)不同蛋白的酵母單克隆分別固定，檢測能與相互作用的蛋白質(zhì)的細(xì)胞。
抗體芯片（Antibody Microarray），是將能識別特異抗原的抗體制成微陣列，檢測生物樣品中抗原蛋白表達(dá)模式的方法。這種抗體微陣列可以在一次簡單實(shí)驗(yàn)中同時檢測樣品中的數(shù)百甚至數(shù)千種蛋白質(zhì)的表達(dá)情況，并且可以在一張芯片上對兩種樣品的表達(dá)模式進(jìn)行比較分析。這使得抗體芯片在毒性實(shí)驗(yàn)、疾病研究和藥物開發(fā)上有廣泛的應(yīng)用前景。
抗體芯片的檢測操作并不要求特殊的技能，一般常規(guī)的操作就可以完成以往極為復(fù)雜耗時的工作。整個檢測操作流程包括：從組織或細(xì)胞、體液中提取蛋白質(zhì)，并用Cy5和Cy3兩種不同顏色的熒光分子分別標(biāo)記被檢測樣品和對照樣品，去除多余的標(biāo)記分子后與芯片雜交孵育，最后掃描分析結(jié)果。整個過程從樣品制備到結(jié)果分析只要一天即可完成。在抗體芯片制作方面，如何獲得高質(zhì)量的抗體，提高特異性、減少交叉反應(yīng)是制作高質(zhì)量抗體芯片的主要考慮因素。