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      Southern 雜交鑒定

      放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-06-28
      1) 取10ul待測DNA,于一定濃度的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳。(20mL,1.0%凝膠,)
      2) 凝膠用溴化乙錠染色,切掉凝膠四周多余部分,并在凝膠的一角作一記號, 拍照
      記錄電泳結(jié)果(拍照時, 凝膠旁放一尺子)。
      3) 雜交用膠的制備 (做以下步驟兩組合一)
      A. 將凝膠浸沒入30mL 0.25mol/L HCl溶液中15min,使DNA脫嘌呤。
      B.用蒸餾水短暫洗凝膠2次。
      C.將凝膠浸沒入30mL變性液中30min, 使凝膠變性。
      D.將凝膠浸沒入30mL中和液中15min使它被中和。
      重復(fù)D一次。在制備雜交用膠時準(zhǔn)備轉(zhuǎn)移的平臺、膜、濾紙等(4、5)。
      4) 準(zhǔn)備DNA從凝膠向膜轉(zhuǎn)移的平臺
      5) 將1張待用尼龍膜和3張厚濾紙切成與待轉(zhuǎn)移膠相同大小,并在尼龍膜一角做一標(biāo)記。
      另1張厚濾紙切成與凝膠相同寬度,長度(約18cm)足以達(dá)到轉(zhuǎn)移液盒子的底部。
      準(zhǔn)備10 X SSC 轉(zhuǎn)移液。
      將待用尼龍膜用蒸餾水浸濕后,再浸入10 X SSC 轉(zhuǎn)移液中。
      6)安裝毛細(xì)管轉(zhuǎn)移裝置
      A.將長的濾紙放在轉(zhuǎn)移平臺的頂部,濾紙兩端達(dá)到轉(zhuǎn)移盒的底部,做成虹吸橋。
      B.將8 0mL轉(zhuǎn)移液倒入轉(zhuǎn)移盒內(nèi),并濕潤濾紙。
      C.將凝膠背面朝上置于濾紙搭成的橋上,凝膠與濾紙間避免有氣泡。
      D.用保鮮紙封住凝膠四邊。
      E.將浸濕的轉(zhuǎn)移膜置于凝膠的上部,凝膠與膜間避免有氣泡。
      F.將剩下的3張濾紙小心的放在轉(zhuǎn)移膜的上面,并放一疊吸水紙搭在濾紙上,再放一
      玻璃板,其上壓一重物。
      G.轉(zhuǎn)移幾小時或過夜(至少4小時)
      注意:勿使轉(zhuǎn)移液干枯。
      7)已轉(zhuǎn)移的DNA與膜交聯(lián)
      A.將膜放在浸有10 X SSC的厚濾紙上,有DNA的一面朝上。
      B.將膜置于UV crosslinker 中,在紫外光下自動交聯(lián)。
      C.用蒸餾水短暫的漂洗已交聯(lián)的膜,空氣中干燥。
      此膜可在4oC長期保存。
      8)DNA探針的制備(略過)
      參照生產(chǎn)商提供的實(shí)驗(yàn)方法合成地高辛標(biāo)記的探針。
      9)印跡的預(yù)雜交
      將適量的預(yù)雜交液DIG Easy Hyb在42 oC預(yù)熱。
      放入印跡膜,在42 oC預(yù)雜交30min。
      10)準(zhǔn)備探針
      水煮地高辛標(biāo)記的探針5min使變性, 并立即放在冰上2min.
      11) 加適量的探針到已預(yù)熱的雜交液中,混合均勻(避免形成泡沫,影響雜交效果)。
      42 oC雜交至少4小時或過夜。
      注意: 不要將探針直接加在印跡膜上,而應(yīng)加在容器一角的預(yù)雜交液中
      12)印跡膜的沖洗:
      A.將雜交液倒出,儲存起來可再次使用。
      B. 用25mL的2 X SSC,0.1% SDS 在室溫?fù)u動洗膜2次,每次5min .
      C. 用已預(yù)熱的30mL 0.5XSSC,0.1%SDS 在65 oC搖動洗膜2次,每次15min (用雜交爐).
      13)免疫檢測:
      A. 用10mL沖洗液洗膜1-5min.
      B. 膜在15mL阻斷液中孵育30min
      C. 膜和8mL抗體孵育30min
      D. 在15mL沖洗液中洗膜2次,每次15min.
      E. 在15mL檢測液中平衡2-5min.
      14)將膜的有DNA的面朝上,放在保鮮紙上,滴數(shù)滴CSPD ready-to-use 覆蓋膜; 然后,立即
      用保鮮紙包裹, 擠掉多余的CSPD ready-to-use,使其均勻平鋪在膜上,沒有氣泡, 但避
      免使膜干掉. 室溫孵育5min.
      15)在37 oC孵育潮濕的膜10min,增強(qiáng)發(fā)光.
      16)用X-光底片將雜交膜進(jìn)行曝光10-25min.
      (發(fā)光性能至少可持續(xù)48小時)
      17) X-光底片的沖洗
      Agfa 30顯影液顯影(1-5min)---沖水(1min)---F5定影液定影(10min)---用水沖洗---晾干底片
       

       

       
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