不僅分析構(gòu)成生物系統(tǒng)的各個因素的活動狀態(tài)（稱為單位過程unit process），而且還要以構(gòu)成整體因素動態(tài)的相互關(guān)系和整個系統(tǒng)為對象，來進(jìn)一步闡明更高級的生物學(xué)特性，系統(tǒng)生物學(xué)就是從整體觀點(diǎn)來綜合研究這種特性的生物學(xué)的一個分支學(xué)科。與工程學(xué)的系統(tǒng)理論和控制理論的發(fā)展相呼應(yīng)，應(yīng)用其他學(xué)科的手段，特別是應(yīng)用數(shù)理的處理。這是從1960年代后半期起發(fā)展起來的。