在種子收獲、脫粒、清選、晾曬、貯藏和運(yùn)輸過程中，不認(rèn)真執(zhí)行技術(shù)操作規(guī)程易造成辣椒種子混雜。應(yīng)采取如下措施:①分品種進(jìn)行收獲，不同品種分別堆放，嚴(yán)防機(jī)械混雜。②在脫粒、清選、晾曬、貯藏及種子處理和播種等操作中，事先要對(duì)場(chǎng)所和用具進(jìn)行清理，并認(rèn)真檢查，清除以前殘留的種子。晾曬種子時(shí)，不同品種要保持較大距離，以防風(fēng)吹或人畜踐踏而引起品種混雜。對(duì)含水量較高的種子不宜在烈日及水泥地上曝曬，以防損傷種子，影響發(fā)芽率。③貯藏、分裝、種子處理時(shí)，容器外均應(yīng)附上標(biāo)簽。注明品種、等級(jí)、數(shù)量、純度。④留種地必須與其他品種保持一定的距離。⑤留種田在育苗和田間生長(zhǎng)期的不同生育階段，進(jìn)行田間檢查，隨時(shí)進(jìn)行去雜、去劣、去病。

二、天然雜交所引起的生物學(xué)混雜

作為常異交的辣椒，由于隔離不夠而發(fā)生不同變種、品種或類型之間的天然雜交(串花)，從而造成非本品種的配子參與受精過程，產(chǎn)生一些雜合個(gè)體，這些雜合體在繼續(xù)繁殖過程中，就會(huì)產(chǎn)生許多重新組合的類型，使原品種群體的遺傳結(jié)構(gòu)發(fā)生很大的變化，造成品種的混雜和劣變。防止品種、變種類型間的天然雜交，應(yīng)進(jìn)行必要的隔離留種:①機(jī)械隔離:主要應(yīng)用于繁殖少量的原種或原始材料的保存。其方法是在開花期采取花序套裝、網(wǎng)罩隔離和大棚溫室采種等。②花期隔離:主要采取分期播種、分期定植，使不同的辣椒品種的開花期前后錯(cuò)開，以避免天然雜交。③空間隔離:這是一條最簡(jiǎn)單易行的措施。只要將不同的辣椒品種、變種、類型相互隔開100米之外，即可進(jìn)行留種。三、留種株數(shù)過少和連續(xù)(近親)繁殖造成退化在良種繁育過程中，留種株數(shù)過少并連續(xù)強(qiáng)行套袋留種，都會(huì)造成品種群內(nèi)基因型的單純化和遺傳基礎(chǔ)貧乏，從而造成品種的生活力降低，適應(yīng)性減弱。因此，留種株數(shù)不宜過少，也不應(yīng)連續(xù)強(qiáng)行留種。