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儀器數(shù)據(jù)采集在LIMS建設(shè)過程中，主要目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)從LIMS中將樣品編號(hào)、檢驗(yàn)檢測項(xiàng)目、方法等發(fā)送到儀器設(shè)備工作站，并從儀器設(shè)備工作站中將樣品編號(hào)，檢驗(yàn)檢測項(xiàng)目、方法、結(jié)果，質(zhì)控結(jié)果等信息發(fā)送到LIMS中，從而實(shí)現(xiàn)雙方向的數(shù)據(jù)自動(dòng)傳輸。儀器設(shè)備的數(shù)據(jù)采集是LIMS能夠極大提升檢驗(yàn)檢測人員效率的功能，因此是否進(jìn)行了儀器采集、儀器采集覆蓋實(shí)驗(yàn)室的儀器數(shù)量、是否進(jìn)行雙向傳輸?shù)冉?jīng)常作為LIMS提升效率的關(guān)鍵評(píng)判標(biāo)準(zhǔn)。
儀器數(shù)據(jù)采集概述
根據(jù)儀器是否具備雙向傳輸條件，將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為雙向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集和單向傳輸儀器數(shù)據(jù)采集。要實(shí)現(xiàn)雙向傳輸，主要有兩種方式一種是通過與網(wǎng)絡(luò)化色諧工作結(jié)（如：Empower、CDS等）集成進(jìn)行雙向傳輸；另一種是直接通過僅器設(shè)備提供的接口協(xié)議進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸。
根據(jù)儀器設(shè)備提供的數(shù)據(jù)傳給接口、工作站的情況等，將儀器數(shù)據(jù)采集劃分為串口數(shù)據(jù)采集、并口儀器數(shù)據(jù)采集、網(wǎng)口儀器數(shù)據(jù)采集、藍(lán)牙儀器數(shù)據(jù)采集、文件儀器數(shù)據(jù)采集等不同的種類，但是，在LIMS建設(shè)過程中，為了達(dá)到儀器接口的統(tǒng)一性，一般會(huì)輔以硬件資源。
將不同的接口轉(zhuǎn)化為統(tǒng)一的接口方式，例如，將串口、并口、藍(lán)牙等通過相應(yīng)的轉(zhuǎn)換器直接轉(zhuǎn)換為統(tǒng)一的無線網(wǎng)絡(luò)傳輸，這樣在LlMS中只需要針對(duì)網(wǎng)絡(luò)傳輸協(xié)議進(jìn)行數(shù)據(jù)處理即可。
需要說明的是，為使數(shù)據(jù)在儀器和LIMS之間傳輸，需要將儀器產(chǎn)生的數(shù)據(jù)上網(wǎng)，但是考慮到實(shí)驗(yàn)室儀器直接接入互聯(lián)網(wǎng)會(huì)造成潛在的安全風(fēng)險(xiǎn)，所以僅將儀器接入安全的局域網(wǎng)，同時(shí)要保證，儀器聯(lián)網(wǎng)技術(shù)不能與儀器工作站的軟件產(chǎn)生沖突。
儀器采集4種方式
01串口輸入設(shè)備采集
宿主服務(wù)下達(dá)采集指令,采集端接收到消息指令通過串口采集設(shè)備檢測數(shù)據(jù)，并將接收到的會(huì)話編碼一并提交宿主服務(wù)或保存采集主控端數(shù)據(jù)庫。
系統(tǒng)通過指定的串口號(hào)、波特率、數(shù)據(jù)位、停止位、校驗(yàn)位、數(shù)據(jù)類型實(shí)時(shí)監(jiān)聽串口變動(dòng)，將監(jiān)聽的數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)存在在系統(tǒng)緩存；
02.文件類輸出設(shè)備采集
檢測人員掃碼將樣品編碼輸入檢測設(shè)備工作站系統(tǒng)，當(dāng)檢測完成后，采集端通過監(jiān)聽文件輸出實(shí)時(shí)解析檢測結(jié)果，并將檢測結(jié)果按照采集端報(bào)文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫。
03.數(shù)據(jù)庫類輸出設(shè)備采集
檢測人員掃碼將樣品編碼輸入檢測設(shè)備工作站系統(tǒng)，如果檢測設(shè)備支持寫入則宿主服務(wù)可以自動(dòng)下發(fā)樣品編碼及相關(guān)數(shù)據(jù)。采集端定時(shí)檢查檢測設(shè)備工作站數(shù)據(jù)庫的輸出，獲取到檢測數(shù)據(jù)后按照采集端報(bào)文格式保存到采集主控端數(shù)據(jù)庫。
04.其他輸出設(shè)備采集
具體需要現(xiàn)場勘察調(diào)研而定。
采集工作站采集過程
1.所有數(shù)據(jù)統(tǒng)一存儲(chǔ)于單機(jī)數(shù)據(jù)庫, 關(guān)聯(lián)人、機(jī)、料、法、環(huán)等信息 (如: 生產(chǎn)設(shè)備、產(chǎn)品批次、測量儀器等)，不能通過網(wǎng)絡(luò)訪問，只能通過本機(jī)計(jì)算機(jī)訪問。后期也可作為LIMS系統(tǒng)質(zhì)量大數(shù)據(jù)平臺(tái)的數(shù)據(jù)采集端使用，保證客戶不會(huì)重復(fù)投入；
2.數(shù)據(jù)采集功能，數(shù)據(jù)采集工具將以客戶端的形式運(yùn)行在與設(shè)備連接的工作站電腦上，主要負(fù)責(zé)將設(shè)備產(chǎn)生的完整的可輸出的原始結(jié)果提取到系統(tǒng)，供實(shí)驗(yàn)室人員進(jìn)行報(bào)告生成、匯總等操作；
3.儀器數(shù)據(jù)采集采用系統(tǒng)+ActiveMQ消息服務(wù)器客戶端的形式實(shí)現(xiàn)，數(shù)據(jù)采集分為兩部分，第一可將需要的樣本編號(hào)等信息以約定的形式發(fā)送給設(shè)備；
4.采集客戶端負(fù)責(zé)進(jìn)行實(shí)際的采集行為的處理，并將采集后的結(jié)果以消息的形式返回。采集客戶端還負(fù)責(zé)將設(shè)備所需的項(xiàng)目編號(hào)等信息以約定的形式發(fā)送給設(shè)備；
5.采集時(shí)根據(jù)各設(shè)備情況可分為手動(dòng)采集和自動(dòng)采集，手動(dòng)采集時(shí)由系統(tǒng)界面發(fā)起采集動(dòng)作；
6.采集客戶端實(shí)時(shí)監(jiān)聽采集申請(qǐng)，客戶端收到采集申請(qǐng)后進(jìn)行相應(yīng)設(shè)備結(jié)果的數(shù)據(jù)采集然后以消息的形式返回給系統(tǒng)完成數(shù)據(jù)采集；
7.自動(dòng)數(shù)據(jù)采集時(shí)由采集客戶端根據(jù)本地配置的采集規(guī)則進(jìn)行定時(shí)的結(jié)果掃描并將需要的數(shù)據(jù)回發(fā)給LIMS系統(tǒng)；
8.實(shí)驗(yàn)人員將分析儀器檢測結(jié)果文件（如PDF、word、Excel、CSV、TXT ） 等從數(shù)據(jù)工作站中導(dǎo)出，存放至指定目錄下；
9.LIMS系統(tǒng)或者開發(fā)的采集數(shù)據(jù)軟件定時(shí)掃描改文件夾，通過解析儀器的檢測結(jié)果文件的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)格式，從文件中提取實(shí)驗(yàn)室結(jié)果信息存儲(chǔ)至LIMS的檢測結(jié)果數(shù)據(jù)庫中。 
